Изменения в политике Александра и противоречия в его армии
Ко времени завоевания восточных сатрапий относится первое открытое проявление недовольства в среде командного состава армии. С военными успехами и расширением завоевательного движения непосредственно связана так называемая ориенталистская политика Александра, его сближение с местной знатью, в которой он рассчитывал найти опору на завоеванных землях.
Перемена происходит и в образе жизни Александра: он стал носить персидскую одежду, завел жезлоносцев и поставил на эту должность уроженцев Азии, приблизил к себе виднейших персов, в том числе брата Дария III. Так Александр и чисто внешне хотел, придать своей власти более деспотический характер. Новая политика обострила противоречия в армии. Оппозиция вышла из среды старой македонской знати, особенно знати равнинных районов (Нижняя Македония), недавних самостоятельных владык, которые с враждой смотрели на трансформацию власти своего царя, превращавшегося в восточного деспота, видя в этом нарушение старых македонских традиций.
В борьбе с ними Александр опирался прежде всего на выходцев из горной (Верхней) Македонии, не пользовавшихся влиянием при дворе и своим возвышением и благополучием обязанных целиком милости Александра. Старая знать была настроена резко отрицательно к продолжению войны, понимая, что по мере роста новой державы Александра возрастает и его власть, тогда как значение Македонии внутри этой державы падает.
Напротив, новая знать готова была идти за Александром, надеясь на выгоды от добычи и эксплуатации захваченных земель. В борьбе с оппозицией Александр еще мог рассчитывать на поддержку основной части войска, состоявшей из македонских общинников. Хотя воины уже устали от долгих и трудных походов и временами среди них велись разговоры о том, что пора возвращаться домой, в борьбе со знатью они были пока готовы поддержать Александра.
Когда был раскрыт заговор Филоты, полководца и одного из ближайших сподвижников Александра, царь по старому македонскому обычаю передал Филоту и его единомышленников на суд армии, которая признала их виновными и предала смерти. В связи с этим заговором был умерщвлен и отец Филоты Парменион — старый и опытный полководец, который в битвах при Иссе и Гавгамелах командовал левым флангом войска.
Вслед за заговором Филоты последовали и другие конфликты. В 328 г. до н. э., когда Александр был уже в Мараканде (совр. Самарканд), на пиру он убил Клита, одного из самых преданных полководцев, спасшего ему жизнь в битве при Гранике. Гнев Александра вызвали обвинения Клита, порицавшего царя за то, что тот окружил себя варварами и рабами, падающими ниц перед его персидскими одеждами, тогда как македонянам приходится просить персов пустить их к царю.
В том же году был раскрыт так называемый «заговор пажей» — молодых людей из знатных македонских семей, которые составляли личную охрану Александра. Они предполагали убить его в постели. Как и в случае с Филотой, Александр передал дело на суд войска, приговорившего всех к смертной казни. Тогда же был казнен и Каллисфен — племянник Аристотеля и официальный историограф похода. Он выражал настроения греков — участников похода, недовольных сближением Александра с персидской знатью.